Se diferencia fácilmente del ratón común (Mus musculus) por su coloración y por tener la cola bastante menor que el cuerpo. A diferencia de este último, el ratón moruno no cohabita con los humanos, ocupa ambientes típicamente mediterráneos subhúmedos y semiáridos. Sus escasos requerimientos hídricos, le permiten ocupar ambientes más áridos e inaccesibles a otros roedores, ocupa espacios abiertos, áreas de matorral, zonas rocosas con vegetación herbácea y cultivos de secano.